Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprsB0V2N1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprsB0V2N1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprsB0V2N1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtprsB0V2N1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PtprsB0V2N1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprsB0V2N1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprsB0V2N1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PtprsB0V2N1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprsB0V2N1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprsB0V2N1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PtprsB0V2N1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PtprsB0V2N1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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