Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap221A9Q751 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms