Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm11127A7VMS2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm11127A7VMS2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm11127A7VMS2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm11127A7VMS2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm11127A7VMS2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm11127A7VMS2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm11127A7VMS2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm11127A7VMS2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm11127A7VMS2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm11127A7VMS2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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