Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms