Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pm20d2A3KG59 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms