Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ism1A2ATD1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms