Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf2A2AT37 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms