Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms