Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms