Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GabreA2AMW3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms