Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VirmaA2AIV2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VirmaA2AIV2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms