Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms