Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap1-3A2A588 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap1-3A2A588 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms