Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm27029A2A4P4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms