Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l1A2A259 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms