Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms