Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms