Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms