Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RNP2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms