Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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