Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms