Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv2A0A0B4J1G8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms