Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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