Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Apobec3Q99J72 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms