Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms