Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms