Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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