Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms