Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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Rpusd3Q14AI6 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rpusd3Q14AI6 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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