Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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