Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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Ccl20O89093 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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Ccl20O89093 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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Ccl20O89093 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccl20O89093 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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