Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms