Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms