Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms