Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccdc71Q8VEG0 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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