Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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Atg4aQ8C9S8 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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Atg4aQ8C9S8 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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Atg4aQ8C9S8 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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Atg4aQ8C9S8 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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Atg4aQ8C9S8 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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Atg4aQ8C9S8 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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