Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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