Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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