Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Sox12Q04890 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms