Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Hoxd13P70217 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd13P70217 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms