Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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