Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RxraP28700 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RxraP28700 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RxraP28700 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RxraP28700 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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