Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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