Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TtrP07309 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms