Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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