Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms