Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms