Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms