Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms