Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms